Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl28Q9JIL2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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