Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms