Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pus3Q9JI38 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pus3Q9JI38 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pus3Q9JI38 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pus3Q9JI38 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pus3Q9JI38 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms