Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3bQ9JHJ5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms