Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn12Q9ET43 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms