Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf3Q9ET30 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms