Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms