Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ropn1Q9ESG2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms