Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hipk3Q9ERH7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms