Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lima1Q9ERG0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms