Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms