Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms