Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms