Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Barx1Q9ER42 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms