Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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Rapgef4Q9EQZ6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms