Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQS9

Igdcc4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igdcc4Q9EQS9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igdcc4Q9EQS9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Igdcc4Q9EQS9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igdcc4Q9EQS9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igdcc4Q9EQS9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igdcc4Q9EQS9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igdcc4Q9EQS9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igdcc4Q9EQS9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igdcc4Q9EQS9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igdcc4Q9EQS9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Igdcc4Q9EQS9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igdcc4Q9EQS9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igdcc4Q9EQS9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igdcc4Q9EQS9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igdcc4Q9EQS9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igdcc4Q9EQS9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igdcc4Q9EQS9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igdcc4Q9EQS9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igdcc4Q9EQS9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igdcc4Q9EQS9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igdcc4Q9EQS9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igdcc4Q9EQS9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igdcc4Q9EQS9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms