Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ndst3Q9EQH7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndst3Q9EQH7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndst3Q9EQH7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndst3Q9EQH7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndst3Q9EQH7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndst3Q9EQH7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ndst3Q9EQH7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndst3Q9EQH7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndst3Q9EQH7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ndst3Q9EQH7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ndst3Q9EQH7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Ndst3Q9EQH7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndst3Q9EQH7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndst3Q9EQH7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndst3Q9EQH7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndst3Q9EQH7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndst3Q9EQH7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndst3Q9EQH7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndst3Q9EQH7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndst3Q9EQH7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndst3Q9EQH7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndst3Q9EQH7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndst3Q9EQH7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndst3Q9EQH7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndst3Q9EQH7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndst3Q9EQH7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndst3Q9EQH7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndst3Q9EQH7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndst3Q9EQH7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndst3Q9EQH7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Ndst3Q9EQH7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Ndst3Q9EQH7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Ndst3Q9EQH7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Ndst3Q9EQH7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Ndst3Q9EQH7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Ndst3Q9EQH7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Ndst3Q9EQH7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms