Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpsf1Q9EPU4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms