Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Tlr1Q9EPQ1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Tlr1Q9EPQ1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Tlr1Q9EPQ1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Tlr1Q9EPQ1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Tlr1Q9EPQ1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Tlr1Q9EPQ1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Tlr1Q9EPQ1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tlr1Q9EPQ1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Tlr1Q9EPQ1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlr1Q9EPQ1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tlr1Q9EPQ1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Tlr1Q9EPQ1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlr1Q9EPQ1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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Tlr1Q9EPQ1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms