Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SyncQ9EPM5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms