Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL5

Mmp1a, Interstitial collagenase A, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1aQ9EPL5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms