Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trmt112Q9DCG9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trmt112Q9DCG9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms