Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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