Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc46a3Q9DC26 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms