Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx6Q9DBY5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx6Q9DBY5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx6Q9DBY5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx6Q9DBY5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx6Q9DBY5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms