Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms