Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms