Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrpraQ9DBG7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms