Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med27Q9DB40 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms