Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pop5Q9DB28 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pop5Q9DB28 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pop5Q9DB28 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pop5Q9DB28 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms