Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnn3Q9DAW9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms