Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cnpy3Q9DAU1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cnpy3Q9DAU1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cnpy3Q9DAU1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cnpy3Q9DAU1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cnpy3Q9DAU1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cnpy3Q9DAU1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnpy3Q9DAU1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnpy3Q9DAU1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnpy3Q9DAU1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms