Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc89Q9DA73 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms