Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp12Q9D9M2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms