Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Actrt1Q9D9J3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms