Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms