Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y7

Tnfaip8l2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms