Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rexo2Q9D8S4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms