Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms