Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C3

Alg13, Putative bifunctional UDP-N-acetylglucosamine transferase and deubiquitinase ALG13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg13Q9D8C3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alg13Q9D8C3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alg13Q9D8C3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alg13Q9D8C3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alg13Q9D8C3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alg13Q9D8C3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alg13Q9D8C3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alg13Q9D8C3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg13Q9D8C3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg13Q9D8C3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg13Q9D8C3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg13Q9D8C3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg13Q9D8C3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg13Q9D8C3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg13Q9D8C3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg13Q9D8C3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg13Q9D8C3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg13Q9D8C3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg13Q9D8C3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg13Q9D8C3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg13Q9D8C3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg13Q9D8C3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg13Q9D8C3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg13Q9D8C3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg13Q9D8C3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg13Q9D8C3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg13Q9D8C3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg13Q9D8C3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alg13Q9D8C3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alg13Q9D8C3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms