Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chmp4bQ9D8B3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms