Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms