Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2c55Q9D816 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2c55Q9D816 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms