Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms