Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Tmem54Q9D7S1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tmem54Q9D7S1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tmem54Q9D7S1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tmem54Q9D7S1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tmem54Q9D7S1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Tmem54Q9D7S1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Tmem54Q9D7S1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Tmem54Q9D7S1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Tmem54Q9D7S1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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