Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Capns2Q9D7J7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capns2Q9D7J7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Capns2Q9D7J7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capns2Q9D7J7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Capns2Q9D7J7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capns2Q9D7J7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Capns2Q9D7J7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capns2Q9D7J7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capns2Q9D7J7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capns2Q9D7J7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capns2Q9D7J7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capns2Q9D7J7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capns2Q9D7J7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capns2Q9D7J7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capns2Q9D7J7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capns2Q9D7J7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capns2Q9D7J7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capns2Q9D7J7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capns2Q9D7J7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capns2Q9D7J7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capns2Q9D7J7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capns2Q9D7J7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capns2Q9D7J7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capns2Q9D7J7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capns2Q9D7J7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capns2Q9D7J7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms