Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpap3Q9D706 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpap3Q9D706 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms