Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc52a3Q9D6X5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms