Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Borcs6Q9D6W8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Borcs6Q9D6W8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Borcs6Q9D6W8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms