Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms